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차라투
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맞춤형 의학통계 지원

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6월 밋업 - Shinykorea

차라투가 후원하는 Shinykorea 밋업의 6월 활동 내용입니다. 오프라인/온라인 병행하여 진행했습니다.

신현석 : Shiny custom UI - Styling Shiny apps with Sass and Bootstrap 4(
https://github.com/shinhseok/public/blob/master/shiny_meetup_hshin.pdf)

김진섭: 올해 만들었던 Shiny앱 공유(
https://blog.zarathu.com/posts/2020-06-20-shinymed2020/)

다음 번 일정과 이전 내용은 아래 링크에서 확인하실 수 있습니다.

연구지원성과- 아시아 조현병 네트워크분석

해운대백병원 정신과 박선철 교수님을 도와 "Research on Asian Psychotropic Prescription Patterns for Antipsychotics (REAP‐AP)" 데이터를 이용, 아시아 조현병 환자들의 추체외로증상 네트워크를 분석하였습니다. 이 연구는 Nordic Journal of Psychiatry 에 게재되었습니다(IF: 2.061).

발표 - 2020년 만들었던 ShinyApps

김진섭 대표는 차라투가 후원하는 6월 Shinykorea 밋업에 참석, 올해 만들었던 ShinyApps 를 공유할 예정입니다. 정리한 슬라이드를 미리 공유합니다.

연구지원성과- 아시아 우울증 네트워크분석

해운대백병원 정신과 박선철 교수님을 도와 "Research on Asian Psychotropic Prescription Patterns for Antidepressants (REAP‐AD)" 데이터를 이용, 아시아 우울증 환자들의 우울 증상 네트워크를 지역별로 비교하였습니다. 이 연구는 Psychiatry and Clinical Neurosciences 에 게재되었습니다(IF: 3.489).

5월 밋업 - Shinykorea

차라투가 후원하는 Shinykorea 밋업의 5월 활동 내용입니다. 오프라인/온라인 병행하여 진행했습니다.

김진환 : Shiny 앱 CRAN 배포 후기(
https://github.com/shinykorea/Meetup/raw/master/20200522/shinycyjs.pptx)
이창선: "R 샤이니" 페이스북 그룹 소개 (
https://www.facebook.com/groups/850457028783173)

다음 번 일정과 이전 내용은 아래 링크에서 확인하실 수 있습니다.

연구계약 - 삼성서울병원 이식외과

본사는 삼성서울병원 이식외과(연구책임자: 이교원 교수) 와 육종(sarcoma) 데이터 분석 계약을 체결, 1년간 이 데이터를 이용한 모든 연구의 분석을 지원할 예정입니다.

앞으로도 양 조직은 긴밀히 협력하여 전문화된 의학연구체계를 만들어 나가겠습니다.

SBS 스페셜 소개: 코로나 대시보드

경기도감염병관리지원단 의뢰로 개발 중인 코로나 대시보드가 SBS 스페셜에 소개되었습니다. 아래 링크 41분 22초에서 보실 수 있습니다.

https://programs.sbs.co.kr/culture/sbsspecial/vod/53591/22000378281

아래는 소스코드 입니다.
확진자 건강관리:
https://github.com/shinykorea/corona-triage
병상현황:
https://github.com/shinykorea/corona-sickbed

4월 밋업 - Shinykorea

차라투가 후원하는 Shinykorea 밋업의 4월 활동 내용입니다. zoom 이용 온라인으로 진행했습니다.

김진섭: TokyoR 81회 밋업 리뷰(
https://blog.zarathu.com/posts/2020-02-11-tokyor81/)
나영준: colorhunt - Hunt the color insight into the color palette. (
http://youngjunna.github.io/presentations/colorhunt)

다음 번 일정과 이전 내용은 아래 링크에서 확인하실 수 있습니다.

연구지원성과- 우울증 네트워크분석

해운대백병원 정신과 박선철 교수님을 도와, 우울증 환자들의 우울, 불안 증상들이 어떻게 연관되어 있는지 확인하는 네트워크분석 웹을 개발하였습니다. 이 연구는 Journal of Affective Disorders 에 게재되었습니다(IF: 4.084).

코로나 대시보드 계약 - 경기도감염병관리지원단

경기도감염병관리지원단(대표 이희영) 의 의뢰로 코로나 19 대시보드 개발을 맡았습니다. Shinykorea 멤버들과 함께 병상현황, 확진자 건강관리 2개의 대시보드를 개발 중이며, 아래 주소에서 진행상황을 확인할 수 있습니다. 이번 프로젝트가 (1) 공공기관과의 협업, (2) 커뮤니티 멤버들의 협업, (3) R/shiny 실전 활용 의 좋은 사례가 될 수 있도록 힘쓰겠습니다.

확진자 건강관리:
https://github.com/shinykorea/corona-triage
병상현황:
https://github.com/shinykorea/corona-sickbed
(스크린샷은 가상데이터)

교육 - R 데이터 매니지먼트 (tidyverse)

김진섭 대표는 3월 18일(수) 부터 6회에 걸쳐, "서울대병원 진단검사의학과 의국원들의 통계분석 능력 함양을 위한 맞춤 교육" 이라는 주제로 R 교육을 진행 중입니다. 2주차 강의록을 미리 공유합니다.

연구계약 - 심혈관중재학회 COBIS 3 레지스트리

본사와 대한심혈관중재학회 분지병변연구회(연구책임자: 구본권) 는 작년에 계약한 "COBIS 3 레지스트리 분석지원" 을 1년 연장하기로 합의하였습니다.

본사는 내년 3월까지 "다기관 후향적 한국 관상동맥 분지병변 스텐트 등록 연구 3 (COBIS 3)" 에서 수행되는 모든 연구의 통계분석을 지원할 예정입니다.

앞으로도 양 조직은 긴밀히 협력하여 전문화된 의학연구체계를 만들어 나가겠습니다.

강의자료- R 데이터 매니지먼트 기초

김진섭 대표는 3월 18일(수) 부터 6회에 걸쳐, "서울대병원 진단검사의학과 의국원들의 통계분석 능력 함양을 위한 맞춤 교육" 이라는 주제로 R 교육을 진행할 예정입니다. 1주차 강의록을 미리 공유합니다.

연구계약 - 삼성서울병원 공통데이터모델(CDM)

본사는 삼성서울병원과 "CDM 기반 분산연구를 통한 암 유발 및 억제 약물 스크리닝" (연구책임자 양광모) 연구계약을 체결, 연말까지 CDM에서 여러 시나리오를 처리하는 분석 환경을 구축하고, 이를 이용한 분석을 지원할 예정입니다.

앞으로 양 조직은 CDM 연구 활성화를 위해 긴밀히 협력해 나가겠습니다.

연구계약 - 서울성모병원 순환기내과

본사는 서울성모병원 순환기내과(장기육 교수) 와 COREA-AMI II 레지스트리 연구계약을 체결, 1년간 이 데이터를 이용한 연구의 통계지원을 맡을 예정입니다.

앞으로 양 조직은 긴밀히 협력하여 전문화된 의학연구체계를 만들어 나가겠습니다.

지원사업 선정 - 인공지능 고성능 컴퓨팅 지원

차라투는 정보통신산업진흥원(NIPA) 가 선정하는 "인공지능 고성능 컴퓨팅 지원사업" 에 선정, 연말까지 GPU 가 포함된 고성능 클라우드를 지원받게 되었습니다. 본사는 이 지원을 활용, 맞춤형 AI 분석을 지원하고 웹에 기능을 추가해 나가겠습니다.

링크:
http://bitly.kr/9YCxJA0G

2월 밋업 후원 - Shinykorea

차라투가 후원하는 Shinykorea 밋업의 2월 활동 중, 공개 가능한 내용을 공유합니다.

이창선 스마트 샤이니 플랫폼 제안: 유튜브(
https://youtu.be/vD3g3cufkEI), PPT(http://bitly.kr/9iHvr9eA)

나영준: LEGO 시리즈별 색상 시각화:
http://adatalab.net/r/2020/02/05/lego-waffle.html

탁온식: 창업지원사업 경험 공유

연구지원성과- COBIS III 심혈관시술 예후 차이

심혈관중재학회 분지병변연구회(회장: 구본권) COBIS III 레지스트리 분석을 위탁받아, 삼성서울병원 순환기내과 최기홍 선생님과 함께, 심혈관 병변과 치료전략에 따른 예후 차이를 분석하였습니다. 이 연구는 Circulation: Cardiovascular Interventions 에 게재되었습니다(IF: 6.060).

논문 링크:
https://www.ahajournals.org/doi/10.1161/CIRCINTERVENTIONS.119.008543

발표 - TokyoR 81회 리뷰

김진섭 대표는 Zarathu 가 후원하는 3월 Shinykorea 밋업에 참석, 일본 R 밋업 중 하나인 TokyoR 중 81회 shiny 특집을 리뷰할 예정입니다. 정리한 슬라이드를 미리 공유합니다.

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